O CIAP segue uma lógica de capítulos até certo ponto similar a Classificação Internacional de Doenças (CID). O CIAP se classifica por motivos pelo os quais os pessoas buscam o sistema básico de saúde, possibilitando ser a utilização desses motivos por vários profissionais, com isso a comunicação entre os profissionais da unidade é melhor. Na Atenção Primária, até 50% das consultas não tem elementos suficientes para se chegar a um diagnóstico determinado. Isto vai de encontro a alguns pontos:
Em terceiro lugar, a CIAP segue uma organização do processo diagnóstico em sete componentes iguais para todos os capítulos:
O CIAP traz sempre três informações que representam o contato da pessoa com profissional de saúde que simplesmente um rótulo que define uma doença: